NT fastlægger ruter og laver køreplaner for tog, expresbusser, regionalbusser, lokalbusser og bybusser udenfor Aalborg. Hvis det drejer sig om tog eller ruter, der kører i mere end en kommune, sker det som udgangspunkt i samarbejde med Region Nordjylland. Drejer det sig om busser, der kun kører i én kommune, sker det som udgangspunkt i samarbejde med den pågældende kommune.
For lokalbusser og bybusser i Aalborg, er det Aalborg Kommune selv, der fastlægger ruterne og laver køreplanerne.
Ansvaret for togdriften i Nordjylland er delt. Nordjyske Jernbaner står for togdriften på strækningen Skørping - Aalborg – Frederikshavn og lokalbanerne mellem Hjørring - Hirtshals og Skagen – Frederikshavn. Arriva Tog står for Thybanen mellem Thisted og Ydby, mens DSB står for togdriften mellem Aalborg – Hobro.